O PPGSAAM trabalha no intuito de auxiliar a comunidade ao qual a Universidade está inserida e, neste sentido, a interação com organizações não acadêmicas é de extrema importância, uma vez que estas dialogam diretamente com a diversidade existente na sociedade. Esta parceria tem por objetivo de desenvolvimento de pesquisas, prestação de serviços e a troca de experiências voltadas para a saúde única.
Das organizações não acadêmicas que interagem com o PPGSAAM pode-se citar o Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais Renováveis (IBAMA), Zoológicos e em Parques Zoobotânicos dos estados do Pará, Amapá, Amazonas, Tocantins e Piauí, propriedades rurais, Agência de Defesa Agropecuária do Estado do Pará (ADEPARÁ), Secretaria de Saúde Pública do estado do Pará (SESPA), Grupo de estudos de Mamíferos Aquáticos da Amazônia do Museu Paraense Emílio Goeldi (GEMAM-MPEG), Instituto Renato Chaves de Castanhal, Agência de Defesa e Inspeção Agropecuária do estado do Amapá, Instituto Mamirauá, prefeituras de outros municípios do interior do estado do Pará e diversas organizações não governamentais (OGNs).